Перший заступник Голови Національного банку України.
З 1998 по 2005 рік вона працювала в банку «Аваль», пройшовши шлях від економіста до директора фінансового департаменту. У 2006-2008 роках була заступником голови правління, членом правління, відповідальним працівником з фінансового моніторингу, радником голови правління ПАТ "ЕрстеБанк".
Після цього півроку, до кінця 2009 року, очолювала департамент безвиїзного банківського нагляду НБУ.
У 2010-2013 роках обіймала посаду заступника голови правління ПАТ "Фінбанк". З 2013 року Катерина Рожкова працювала заступником голови правління ПАТ "Платинум Банк", а з 2014 року і до червня 2015 року - виконувала обов'язки голови правління цього банку.
З 10 червня 2015 року по 18 січня 2016 року обіймала посаду директора Департаменту банківського нагляду НБУ. Після чого стала в.о. заступника Голови НБУ. У жовтні 2016 року стала заступником Голови НБУ.
Рада НБУ 15 червня 2018 року призначила її першим заступником Голови Національного банку України